El palacio fue mandado construir por los Marqueses de la Encomienda que llagaron a Almendralejo en el siglo XVII y habían vivido hasta entonces en el palacio que fue el antiguo ayuntamiento. El edificio, declarado Bien de Interés Cultural, se construyó en la segunda mitad del siglo XVII y a finales del mismo ya vivían en él y desde entonces pertenece a esta familia.
El palacio ocupa una gran extensión de terreno, es de estilo barroco y está realizado con mampostería y ladrillo revocado. El edificio tiene un eje principal que es el patio central y en torno a él se distribuyen todas las dependencias principales de la casa, mientras que las habitaciones del servicio se ubican alrededor de un patio interior.
La fachada se caracteriza por ser una fachada muy simétrica, tiene dos plantas bien diferenciadas por medio de una imposta; en la primera planta destaca la portada de mármol adintelada con molduras decorativas.