La primitiva Iglesia de la Concepción databa del S. XVI y, junto con el hospital del mismo nombre, se asentaba en el terreno que hoy ocupa el vecino Convento de los Remedios. La traza actual de la Iglesia de la Concepción se fija en 1768 y se atribuye a uno de los mejores arquitectos del S. XVIII español, Ventura Rodríguez, colaborador también en el Palacio Real de Madrid.
Destaca exteriormente por su gran cúpula central, visible desde cualquier punto de la ciudad, formando parte de uno de sus perfiles más definitorios. De estilo tardobarroco, son las dos portadas de cantería labrada de típica ejecución portuguesa, presentando escudos de la orden franciscana enmarcados por rocallas. Sobre ellas se abren dos hornacinas y entre ellas destaca el magnífico escudo de Manuel Godoy. Interiormente la planta es circular o elipsoidal. Un precioso templete construido de 1876 contiene a la imagen titular, la Inmaculada, obra del S. XVIII.